| [No 1]：ゼムナス |
- １３機関のリーダーでナンバー1
- キングダムハーツを手にいれるためソラたちを利用している
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| 出現場所 |
| 存在しなかった世界 |
| [No 2]：シグバール/Xigbar |
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- 眼帯をしている
- 信頼性の低い言動を繰り返し、ソラたちを迷わせる。
- いかにも悪そうな奴
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| 出現場所 |
| 存在しなかった世界 |
| [No 3]：ザルディン/Xaldin |
- キングダムハーツを手に入れるために、ビーストを利用しようとしている
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| 出現場所 |
| ビーストキャッスル |
[No 4]：ヴィクセン/Vexen |
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- COM忘却の城のなかにいる「機関」メンバーでは一番古株。
- 自分より格下であるにもかからわず城をまかされたマーシャルを嫌っている。
- 城の地下で独自の研究に取り組んでいたが、マールーシャたちの不穏な動きを探るために地上に向かった。
- 普段は冷静なものの、挑発されるとすぐカッとなる。
- マールシャの命令でアクセルに殺されることに。
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[No 5]：レクセウス/Lexaeus |
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- 忘却の城の地下を管理している。
- メンバーには珍しい武人タイプで、巨大なトマホークを軽々と使いこなすが、乱暴なところはなく、もの静かで思慮深い。
- マールーシャたちのたくらみに気づきそれを阻止するために、「リク」を利用しようとするが失敗する。
- ＣＯＭでリクに倒される。
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[No 6]：ゼクシオン/Zexion |
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- レクセウス、ヴィクセンとともに忘却の城の地下を管理しており、3人の中ではリーダー的存在。
- 「機関」ではナンバー6
- ずるがしこい策略家で、直接手を下すより、裏で策をめぐらせることを好む。
- 常に落ち着いた丁寧な言葉づかいで話し、礼儀にうるさい。
- ＣＯＭでリクに倒される。
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| [No 7]：サイクス |
- 13機関のナンバー7
- 単独行動に走ったアクセルをどこまでも追い続けていた。
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| 出現場所 |
| 存在しなかった世界 |
| [No 8]：アクセル/Axel |
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- とらえどころのない「機関」のナンバー8
- 一見、目先の楽しみばかり追っ手いるようだが、腹の底は決して見せず、その考え方は仲間でも理解できない。
- マールーシャたちの反乱計画に加担しつつもソラに助言を行うなど、色々不可解な行動をとる。
- ソラとは何か因縁があるらしい。
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| 出現場所 |
| トワイライトタウン |
| [No 9]：デミックス/Demyx |
- シタールと呼ばれる楽器を使いながら、水をたくみにあやつったが戦闘はあまり得意ではない
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| 出現場所 |
| レイディアントガーデン |
| [No 10]：ルクソード/Luxord |
- 時を操るギャンブラー
- ゲームを遊ぶかのように戦いを楽しんでいる
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| 出現場所 |
| 存在しなかった世界 |
[No 11]：マールーシャ/Marluxia |
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- 忘却の城の管理責任者。
- ナンバーは11で「機関」の中では新参者の部類に入る。
- 「ソラ」を取り込もうという「機関」の計画を私的に利用することで、「機関」そのものを乗っ取ろうと画策したが失敗した。
- ソラたちにCOMで倒される。
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[No 12]：ラクシーヌ/Larxene(女) |
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- 「機関」唯一の女性でナンバーは12.
- COM忘却の城地上を管理しており、城の主マールーシャと組んで「機関」の乗っ取りをたくらむ。
- 性格は冷酷でヒステリック。
- 他人の心を傷つけ踏みにじることに、喜びを感じるが、自分の自尊心が傷つけられるのは我慢ならない。
- ソラたちにCOMで倒される。
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| [No 13]：ロクサス/ |
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| 出現場所 |
| オープニング |
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